Prvé neoficiálne florbalové družstvo vzniklo okolo Petra Ševčíka a tvorili ho bývalí hokejbalisti, ktorí začali trénovať v telocvični cirkevnej základnej školy. Postupne oslovil florbal aj ďalších záujemcov a tak vymenili tréningovú plochu telocvične ZŠ za palubovku športovej haly, kde od septembra 2005 začalo trénovať budúce jadro klubu. Na jeseň 2005 sa klub zaregistroval ako občianske združenie a v tom istom roku aj na Slovenskom zväze florbalu pod názvom IBK Malacky. Historicky prvý zápas sa konal 27. 11. 2005 v ŠH Malina, ke si družstvo IBK Malacky prvýkrát pred zrakmi divákov zmeralo sily s družstvom TJ Sokol Lanžhot. Ďalšie skúsenosti zbierali muži v mestskej lige v Trenčíne, na turnajoch a priateľských zápasoch. Prvé súťažné skúsenosti získali malackí hráči v máji roku 2006 v baráži o postup do extraligy, kde si zmerali sily o dve postupové miesta štyri družstvá: ŠK Lido Bratislava, M-Šport Salming Team Trenčín, ŠK Seahorses Bratislava a IBK Malacky. Malačania na skúsenejších súperov výsledkovo nestačili. V sezóne 2006/07 vstúpilo družstvo mužov IBK Malacky do 2. ligy mužov. V roku 2010 prišlo k spojeniu klubu IBK Malacky s ďalším malackým klubom, ktorý pôsobil v súťažiach Slovenského zväzu florbalu od roku 2007. Spojením obidva kluby deklarovali spojiť sily, hráčsky ale i finančný potenciál, s cieľom výraznejšie rozvíjať florbal v Malackách. Spojením oboch klubov prišlo aj k zmene názvu klubu na 1. SC Malacky. Od vzniku klubu pôsobili v súťažiach SZFB okrem mužov aj iné družstvá klubu od mladšej prípravky až po ženy. Mnohé družstvá pôsobia v klube až do dnes. Cieľom klubu je vybudovať kompletnú vekovú štruktúru družstiev.